浩罕汗国对新疆的入侵得到了喀什噶尔、英吉沙尔、喀喇沙尔三城阿奇木伯克的响应，叶尔羌、和阗、阿克苏的阿奇木伯克则宣布独立，并派人要同浩罕汗国结盟。
    浩罕汗国的入侵，新疆回部的叛乱，让宁夏、甘肃的一些教徒以为建立一个伊斯兰教国的机会来了。从浩罕汗国刚刚传入中国的新教徒们，发起了屠汉叛乱。
    共和国统一全国之后，虽然废除了旧清一些歧视回民的政策，但是共和国除了大力发展联通各地的铁路和公路建设以外，同样制定了不许宗教干涉地方事务的规定。
    共和国的规定无疑是剥夺了甘肃、陕西、宁夏等地清真寺对于教众的管理权力，对于各清真寺的教长来说，他们感觉自己的权力受到了侵犯。
    而甘肃、陕西、宁夏等地在共和国建立时，基本上都是和平归顺于中央的，因此在这些地方的驻军并没有进行大规模更替。在当地回民眼中，共和国和清朝似乎并没什么区别。
    因此当新疆回部叛乱的消息传来之后，宁夏金积堡地区的新教回民首先发动了叛乱，他们一边大肆屠杀周边的汉村，一边举起了独立建国的口号。
    由于当地汉人遵守法律，没有私藏武器。而以清真寺为领袖的回民聚落，一向保持着半军事化的组织，回民一叛乱就占据了上风。短短半个月内，宁夏、甘肃近10多万汉人被屠杀殆尽。
    虽然开通了铁路，但是尚没有有线电报的中国，当甘肃、宁夏回民叛乱之后，北京才得到了这个消息。
    对于参与过新法兰西对印第安战争的林盛和等人来说，对于这种民族叛乱是最为敏感的。
    林盛和召开了紧急的国民会议，在会议上他并没有先报告平叛的各项事宜，而是要求国民会议通过一项法律，剥夺参加叛乱回民的共和国国籍。
    议长陶澍大为吃惊的问道：“总统先生，现在我们不是应该优先讨论如何平叛，然后再对叛乱的回民进行处置的吗？”
    林盛和表情严峻的说道：“这不是一次叛乱，这是共和国各民族的敌人企图屠杀共和国人的阴谋，对于同浩罕汗国勾结的回民，他们已经不能再享有共和国法律的保护。如果在这一点上不做出澄清，那么共和国的军队将会在接下来的战争中失去方向。”
    国民议会的议员们并不了解林盛和是什么意思，不过为了能尽快回到平叛的事项上来，很快他的提议就被通过了，共和国的议会做出决定，叛乱的回民不再受到法律保护，同时所有服从于共和国法律的清真寺，都必须改为用中文传教。
    原本在山西集结的，准备用来在外蒙古驻军的5万部队，改变了方向，转道陕西进入甘肃、宁夏平乱。而驻扎在包头的骑兵第1、3、8师也向西进入甘肃、宁夏平乱。
    共和国的军队刚刚进入陕西时，就听到了又一个坏消息。因为甘肃、宁夏的民族大屠杀，导致陕西民众对于当地回民产生了不信任感，因此陕西各地的汉人士绅要求当地政府收缴回民的武器。
    陕西黄河以北地区的回民人数不多，对于这场叛乱和建立伊斯兰国并不感兴趣，在得到了地方官员保证回民村落的安全之后，就顺从的交出了武器。
    而靠近甘肃、宁夏地区及关中平原地区，因为回民村落众多，加上害怕武器被收缴之后，引起汉人村落的报复，因此拒绝交出私藏的武器。
    在甘肃、宁夏地区清真寺派来的教徒的诱惑下，临潼的回民村落第一个发起了叛乱，此时刚好一只陆军部队正奉命从三门峡前往西安，加强西安的防御工作。
    当地回民的叛乱，很快被这只过路的军队镇压下去了。不过县城以外有十多个汉人村落被屠杀殆尽。
    被击退的回民武装，仓皇的逃过了渭河，向宝鸡退去。在逃亡的途中，他们不断的勾连回民，对逃亡途中遇到的汉人村落进行屠杀。一方面是为了获取粮食等物资，一方面则是迫使周边的回民村落在害怕被汉人报复下，加入回民的叛乱中。
    一时之间关中平原上烽火处处，这些陕西回民以为只要聚集起足够的力量，就能抵御住中央政府的清剿，进而迫使其进行谈判。
    原本作为外蒙古驻军司令的乌长风，在新法兰西同印第安的战争中，就被称为屠夫。
    林盛和正是看重了他的刚强和冷酷的性格，才准备用他来威慑那些在俄国和共和国之间摇摆不定的蒙古王公们。
    但是事发突然，驻蒙军不得不得不进入西向平叛。刚刚进入陕西时，乌长风还命令自己的军队要注意维护和当地回民保持关系，不要激化汉回之间的矛盾。
    但是随着林盛和的新命令到达，及关中平原对汉人的屠杀事件爆发之后，乌长风迅速转变了态度。
    一方面他命令一个军9千人先行赶赴关中平原，阻止当地的屠杀事件，另一方面则把部队分成3部分，北路进入宁夏，中路进入甘肃，南路支援关中平原。
    除此之外，他下令征发陕北地区回民的青壮开始修筑延安至宁夏、甘肃的道路。
    11月12日，陕西的叛乱回民被共和国的军队赶入了甘肃和陕西的宝鸡地区。
    由于进入甘肃的通道已经被共和国军队切断，十多万回民叛军盘踞在宝鸡进退不得，叛军领袖不得不向乌长风进行投降。
    乌长风砍杀了送信的使者，根本不理会这些欺软怕硬的匪徒。他一面下令军队封锁宝鸡和外界的一切通道，一边开始在关中平原清剿回民村落。
    渭河两岸原本是关中最为人烟稠密的地带，在回民叛乱之后，汉人被屠杀的几乎达到了30余万，这还是因为乌长风军队赶到的及时，才没有让关中平原成为汉人的墓地。
    关中600万汉人，被屠杀了30多万，几乎是家家都有亲友伤亡了。
    这种仇恨，顿时成了对于共和国政府最强烈的支持。在军队的协助下，报仇雪恨的关中子弟，纷纷要求参军，以惩罚掀起了这场大屠杀根源的浩罕汗国。
    11月19日，宝鸡的叛回向甘肃方向突围，结果死伤惨重，再次退回了宝鸡。11月22日，乌长风下令对宝鸡发动总攻，不留一人。
    12月3日，清剿了宝鸡叛回的乌长风率军进入了甘肃，而他派出的进入宁夏剿回的军队，也成功的把宁夏叛回赶入了甘肃。
    甘肃叛回的主力此时还在围攻兰州，甘南地区的回民闻风逃入了青海，兰州城下的叛回终于失去了此前高喊独立建国的勇气，开始向西逃窜。
    乌长风在兰州和友军会合时，也同时得知了左宗棠不仅保住了张掖，还在蒙古骑兵的支援下平定了甘肃走廊的回民叛乱。
    对于左宗棠的能力，乌长风很佩服，但是对于他对投降回民的安抚政策，乌长风则感到不满。
    他令军队进入青海追赶逃亡的叛回，自己则带着卫队坐火车抵达了张掖，准备亲自动手清除甘肃走廊内的叛回。
    在车站迎接他的左宗棠，听了他的命令之后，表示反对。他主张可以迁移这些回民，但是斩尽杀绝并不是上策，新疆、甘肃等地少数民族众多。
    如果今天对已经投降的回民进行屠杀，只会让其他少数民族对于共和国感到恐惧，让这些少数民族更为坚定的投靠外国势力。
    乌长风不在乎的说道：“左委员，我想你过于担忧了。在当代，彻底消灭一个民族才是解决问题的最好方式，中国以前只所以对异民族采用怀柔政策，那是因为用刀进行杀人实在是太没有效率了。
    但是今天，钢铁和火药可以很轻易的消灭一个民族。相信我，解决问题最好的方式，就干掉制造问题的麻烦者。
    甘肃走廊是联通内地和新疆的要道，共和国决不能让它处在一群心怀异心的叛回手中。而且共和国议会，已经剥夺了这些人的权力，他们是不受法律所保护的人。”
    只是兰新铁路修建委员的左宗棠根本无法阻止乌长风，但是从哈密赶回来的魏源阻止了他。
    在胡林翼提出的迁回入疆，以回治回之策后，乌长风终于还是妥协了。因为北京发了一道命令，要求他尽快入疆平乱，不能让浩罕汗国在新疆站稳脚步。
    当甘肃、宁夏、陕西、云南回乱渐渐平息后，林盛和得到了一个统计，三地汉人死伤几达130余万。
    江南财团趁机鼓动了舆论，在报纸上把这场回民叛乱当做了林盛和施政不当的污点，这使得林盛和收复外蒙而获得的声望化为乌有。
    俄国人进入冬季之后，就撤离了谈和使者，也让林盛和知道，之前的谈判完全是俄国人的骗局。
    而且浩罕汗国、云南回乱的背后都出现了英国人的影子，这些都让他感觉到，想要见好就收的作战计划已经不能满足共和国民众的想法了。
    1836年元旦，林盛和在新年谈话中，谴责了英国、俄国对共和国种种不友善的举动之后，更着重提及了浩罕汗国背后的阴谋。
    他最终总结道，这是俄国、英国的邪恶势力同卑劣的浩罕汗国联合，对伟大共和国的疯狂进攻。除了作战，共和国别无选择。130余万共和国公民的血，需要十倍于此的鲜血来偿还。